Tofaş altyapısında yetişen Cüneyt Erden, 1995-96 sezonunda A takıma yükseldi. Tofaş'ta forma giydiği 5 sezonda 2 TBL, 1 Türkiye Kupası şampiyonluğu yaşadı.
Tofaş’ın A takım faaliyetlerini sonlandırmasının ardından 2000 sezonu başında Türk Telekom’a transfer oldu. İki sezon bu takımda oynadıktan sonra 2002-03 sezonu için Pınar Karşıyaka ile anlaştı. Sezonu Pınar Karşıyaka ile açmasına karşın kısa bir süre sonra takas yolu Darüşşafaka’ya transfer oldu. Darüşşafaka’da maç başına ortalama 14.1 sayı – 5.0 asist – 3.7 ribaunt üreterek kariyerinin en iyi sezonlarından birini yaşadı.
2003-2004 sezonunu 14.0 sayı – 4.7 asist - 3.3 ribaunt ortalamaları, 2004- 2005 sezonunu ise 10.5 sayı – 5.0 asist – 2.7 ribaunt ortalamaları ile tamamladı.
2005-2006 sezonunda Ülker’e transfer olan Erden, 2006-2007 sezonunda ise Efes Pilsen formasını giydi. Geçen sezon 27 maçta 5.81 sayı ortalaması yakalayan Erden, maç başına 2.6 asist yaptı. Euroleague’de ise 4.8 sayı, 1.2 asist ile oynadı.